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2021年01月25日

当前位置:首页 > 招标信息 > 辐射照射大鼠组织样本的单细胞测序

辐射照射大鼠组织样本的单细胞测序  咨询本项目

采购与招标网   网络通讯计算机   跨省   2025-10-22
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招标代理公司(立即查看) 受业主单位(立即查看) 委托,于2025-10-22在采购与招标网发布 辐射照射大鼠组织样本的单细胞测序。现邀请全国供应商参与投标,有意向的单位请及时联系项目联系人参与投标。 1、完成6例大鼠组织样本的解离、标记建库、测序及(略)析; 2、正式实验前(略)个工作日必须提供一次大鼠组织样本预实验,并提供解离和细胞活性报告。 *3(略)、测序和数据质控要求: a.细胞悬液要求:细胞活性≥(略)%,细胞浓度为(略)~(略)cells/µl,结团率<5%,有核率>(略)%,细胞数大于(略)要求:利用CountStar荧光计数法进行细胞计数;利用(略)x G(略)及官方配套试剂完成样本捕获并构建文库,使用V4试剂。 c.测序需要求:要求使用Illumina NovaSeq (略)进行PE(略)测序;测序质量要求:文库质检合格后,每个转录组文库测序数据量≥(略)G,测序Q(略)>(略)%,无GC(略)离; d.数据质控要求:测序数据基因组比对率≥(略)%,目标捕获细胞数浮动范围在(略)%以内,细胞平均reads>(略)k,细胞基因中位数≥(略); 4、须提供标准生信(略)析内容,主要包括:数据质控与过滤、细胞聚类及(略)群展示、细胞亚型(略)析、Marker基因(小提琴图、热图、映射图、dotplot图)(略)析、差异表达基因GO功能(略)析(柱状图、气泡图)、差异表达基因KEGG pathway功能(略)析(柱状图、气泡图)及可视化结果、细胞类型注释、结果报告完(略)解读; *5、具备独立(略)析团队,须提供高级生信(略)析内容,主要包括:细胞重新(略)群、拟时序(略)析、细胞间通讯(略)析(Cellchat(略)析方法和CellphoneDB(略)析方法)、基因集(略)析、样本间比较及GO或KEGG(略)析、基因表达展示(热图、散点图、小提琴图、气泡图)、拷贝数变异(略)析(inferCNV和copykat)、单细胞轨迹(略)析(CytoTRACE)、单细胞WGCNA(略)析、GSVA(略)析和GSEA(略)析; 6、具备熟悉掌握(略)x单细胞测序的技术人员、(略)x官方CSP认证(须提供仪器(略)合同或租赁合同或有效发票或设备资产证明复印件证明); *7、所有检测产生的原始数据(raw data)及数据(略)析过程中产生的数据均需要交付,实验完成周期为收到样本后的(略)个工作日内。 *8、具备(略),可以不限时使用支持后续数据(略)析研究。
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